一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統續作，一克帝國一統十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區的東伐西討、南征北戰，以及探秘發現未知區域及其他國度的奇幻旅程（根據小說一克帝國異域志內容改編而成）。

在未來，渴望具象成現實，面對未知的挑戰，充滿熱情和希望就是真英雄。

由于人族的貪婪，其他種族逐漸在一次次的混戰中隱匿了痕跡——混戰中水中界被納入地上界版圖，除了精靈族，現在地上界的情況是這樣的：異族在人族中只剩下了傳說和教會的宣傳口號，但是除了精靈族外的其他種族其實在地上界還各有活動，只是隱藏了真實身份。拉法爾，來自天上界的精靈，由于不可告人的秘密來到人間界，遇見各色各樣的人類，并與其中三個伙伴組成團隊一起粉碎邪惡的陰謀。

魔族最強魔尊的無用，因為身上的一半人族血脈遭到背叛暗算，神識與天道互相感應，得到外掛“太初神魂”。強勢再起的無用，一路殺妖誅魔，一統五族，向上位仙族發起逆天之戰，創造第七種族“神族”。我即六界主宰，我即神天至尊！

一個滿是“門”的空間，這里被稱之為閥限世界，在這里門就是水閥，怪物是水流，一旦閥門失控怪物便會破門而出，如潮水般的涌入現實世界， 而兩個時間線里的兩支隊伍，分別是無以名為首的神仙組，段武常為首的超物質調查團隊，他們為阻止這場末日浩劫，決定奮力一戰！ 隨著調查的深入，一個更大的陰謀浮出水面！