明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

董明身為董家家族天才，突遭族兄暗害被廢全身筋脈，期間又被陷害，最后被迫離開家族和姨娘相依為命。 董明不甘如此，他不斷努力，想要重回巔峰一雪前恥！ 命運總是眷顧努力的人，董明得到了上代人皇守護“靈小塔”的幫助和賞識。靈小塔本奉命來尋找下代人皇，巧與董明結緣，傳給了他修煉之道，助董明逆天改命。 從此董明修為不斷攀升，最終開拓出一條人類修行的最強道路，“人皇”之道！

男孩吃了一顆奇怪的果子，身體開始膨脹......