明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

由于人族的貪婪，其他種族逐漸在一次次的混戰中隱匿了痕跡——混戰中水中界被納入地上界版圖，除了精靈族，現在地上界的情況是這樣的：異族在人族中只剩下了傳說和教會的宣傳口號，但是除了精靈族外的其他種族其實在地上界還各有活動，只是隱藏了真實身份。拉法爾，來自天上界的精靈，由于不可告人的秘密來到人間界，遇見各色各樣的人類，并與其中三個伙伴組成團隊一起粉碎邪惡的陰謀。

丹田被廢，淪為劍奴！愛人背叛，雪上加霜！直到作為父親遺物的神秘天書覺醒……“這一次，欠我的，一個不落，我都要討回來！”少年一人一棍，踏碎凌霄，斬圣人，滅神魔，終成一代武極天尊！

很久以前，妖獸橫行，禍害人間，百姓民不聊生。就在這時，一位仙人出現，他將妖獸引領到一個世外秘境，這個秘境被后人稱之為“山海界”。 數百年過去了，某一天仙人設下的結界受到破壞，部分靈獸出逃人間，為了將靈獸尋回，現任守界者靈發仙人來到人類的世界。然而此時此刻，孟然和同學正因為誤闖后山而遇到傳說中的兇獸窮奇……