明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

洛傾衣因為父親冤死，洛家滿門抄斬，恨透當朝皇上秦清軒，為了報仇，處心積慮進入皇宮，本是為了刺殺，不想被秦清軒感動，愛上秦清軒，可是被奸人挑撥差點害死了心愛的人，才知殺害自己的根本不是秦清軒后悔無比，索性最后二人都大徹大悟，經歷重重磨難終于達成了白頭偕老的美滿結局。

健神學院同宿舍的李飛、雪千化、沈曉時三人因為不同的悲慘遭遇，在絕境中分別獲得滅欲狂刀、欲望之眼、時間之刃的異能。雪千化控制別人欲望得到了一切，但他卻得不到曾經失去了的，看著李飛美好而幸福的生活后就感覺上天對自己太不公平，嫉妒李飛的他唯獨不能控制李飛，他便操縱別人從各方面攻擊李飛，更多的異能者參與進來，他們在格斗場上斗智斗勇斗心志。哪種異能能夠披荊斬棘脫穎而出成為最后的勝者呢？讓我們拭目以待吧……

一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統續作，一克帝國一統十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區的東伐西討、南征北戰，以及探秘發現未知區域及其他國度的奇幻旅程（根據小說一克帝國異域志內容改編而成）。