很久以前，妖獸橫行，禍害人間，百姓民不聊生。就在這時，一位仙人出現，他將妖獸引領到一個世外秘境，這個秘境被后人稱之為“山海界”。 數百年過去了，某一天仙人設下的結界受到破壞，部分靈獸出逃人間，為了將靈獸尋回，現任守界者靈發仙人來到人類的世界。然而此時此刻，孟然和同學正因為誤闖后山而遇到傳說中的兇獸窮奇……

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

車禍身亡的林淵，意外地穿越到了平行世界，并成為了一頭自帶簽到系統的怪獸！在馬里亞納海溝簽到，獎勵“吞噬能力”！在極淵島簽到，獎勵“爆裂吐息”！在極寒冰原簽到，獎勵“紅蓮形態”！在亞馬遜雨林簽到，獎勵“破壞神形態”！不過，林淵秉著不無敵就不出世的念頭，在極淵島上默默簽到了三十年……三十年后，外星艦隊進攻地球？黑暗泰坦集齊六顆滅世寶石？異族怪物大舉入侵？黑暗宇宙妄圖覆滅人類文明