白宇宙重型生命體對黑宇宙的探知中，因為無規則異界王族的介入，導致維度空間和亞空間產生無法避免的沖突，而在黑宇宙中和白宇宙重型生命體更加不兩立的戰鐵族，似乎可以平息這場紛爭，但是，萬事就怕但是……

原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。

在人類快速的發展下，人類和妖怪之間的平衡被打破。隨著環境的破壞，妖怪也不得不背井離鄉生活在人類城市。然而妖怪卻沒有屬于自己的法律保障和社會權力，這是一個人類為妖怪構建的反烏托邦！那么妖怪們究竟要如何擺脫這悲慘的命運呢？

少年生活在一個人類與怪物共存的大陸—紙風車之國，平靜的日常下危機四伏…