一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統續作，一克帝國一統十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區的東伐西討、南征北戰，以及探秘發現未知區域及其他國度的奇幻旅程（根據小說一克帝國異域志內容改編而成）。

甲級戰犯死死惡重現于世，打破了本就虛偽又脆弱的和平。為了保全利益，蟲重勢力與其大打出手，揭開了大戰的帷幕，而引起這場戰爭的，卻是一個因身負詛咒才來到此地，勉強擦邊才通過了入學考核不久的姚命同學。殊不知，他進入的，是一所被卷入漩渦中心，且被世人憧憬又忌憚的毀滅之地。它，被稱之為—黑幫大學。

少年生活在一個人類與怪物共存的大陸—紙風車之國，平靜的日常下危機四伏…

一個荒廢的小鎮里出現了恐怖的生物……

神族少女為了保護家人，瀕死之際將軀體貢獻給了魔尊，請求魔尊庇護自己的家人。擁有新軀體的魔尊偶遇了一位特殊體質的人族少年，少年與魔尊的故事即將展開……