明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……

英雄好漢，傳奇故事

半吊子除靈師參上！ 都市的街頭，一群吃人的「念靈」正悄悄在人類世界擴張他們的勢力。 項飛，一個半吊子除靈師，在將‘貪’念靈消滅之際，卻被念靈意外侵入體內，自此命運之輪緩緩轉動…… 在這個物欲橫流的大都市里，每個人都擁有自己的欲望。 當欲望開始失控，產生邪念，它就能凝聚成型，化為靈體，從而控制人類。 這種靈體生物，人們稱之為‘念靈’！ 所謂萬物相生相克，有靈，便會有除靈。