一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統續作，一克帝國一統十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區的東伐西討、南征北戰，以及探秘發現未知區域及其他國度的奇幻旅程（根據小說一克帝國異域志內容改編而成）。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

葉小天世襲罔替，卻非王侯；他出身世家，卻非高門。作為六扇門中的一個牢頭兒，他本想老老實實把祖上傳下來的這只鐵飯碗一代代傳承下去，卻不想被一個神棍忽悠出了那一方小天地，這一去，便是一個太歲橫空出世。

花如錦集團總裁李高揚意外得罪自稱財神的超能力女外星人，一夕之間家 財散盡。為了討生活，平時呼風喚雨的總裁不得不“孝敬”起這尊看似高冷女 王實則邋遢大王的邪門“財神”。一人一“神”在表面和諧，私下暗暗較勁的 過程中，共同對抗命運，收獲成長。

修真少女渡劫飛升，引九天神雷擊毀天庭寶庫。屌絲少年孽緣巧合，與聚寶盆融為一體。天庭寶物散落人間，各路神魔垂涎三尺。一場由法寶引起的“血雨腥風，明爭暗斗”；“前世今生，恩怨纏綿”就此拉開。