原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。

這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……

“要是在游戲世界里，我就是英雄了！”被隊友背靠著背以一擋百，被美女們糾纏著手臂撒嬌，力戰惡龍挽救公主，相信每個宅男都有如此想過吧...主角風間良正是這樣子的一名宅男，在學校被同學欺凌，被愛慕的女神嫌棄，唯一能慰藉存在感的就只有游戲。把感情封鎖在心底深處，每日都幻想可以進入游戲世界里。他的愿望…竟然成真了