一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統續作，一克帝國一統十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區的東伐西討、南征北戰，以及探秘發現未知區域及其他國度的奇幻旅程（根據小說一克帝國異域志內容改編而成）。

妖神一出，誰與爭鋒？ 這是一個妖靈的世界，融合了妖靈，就可以成為強大的妖靈師。 因為一本時空妖靈之書，時空發生了扭轉，當一切重新開始之時，命運之輪緩緩轉動。

人類與靈的混血少女的血居然可以治愈妖怪難以恢復的傷，于是與各類妖怪帥哥談談戀愛冒冒險的故事就此展開~

原本中醫系畢業的張機，因為中醫不容樂觀的就業情勢，于是打算轉行“更有前途”的西醫。然而某天他回家后，發現家中多了位不速之客——醫仙【岐伯】。岐伯以“因為你是張機（張仲景）”為理由，將“重振中醫”交給了張機。 為了讓張機可以勝任“重振中醫”的重任，岐伯遣藥靈親自教導張機中藥的配伍使用，并將一本可以與藥靈訂立契約的《玉函本草集》交由張機，同時讓人參【任弦】作為張機的幫助與監督者。