佛族的三藏法師因為與女兒國國王約會而受到佛族與神族的誅殺，他的弟子齊天、天蓬、悟凈為了保護師父，不惜與諸神開戰！在混戰中因齊天與二郎神斗法發生大爆炸打碎了太虛幻境的中樞“通靈寶玉”引發太虛幻境的崩塌。唐僧的三名徒弟醒來后發現自己居然被炸到了21世紀的現代社會，三人失去神力。為了生存他們只好一邊打工賺錢一邊尋找回去的方法……

死后五百年，還被人們銘記的人，他們的靈魂便可以成為“靈體”。 根據現代人的印象，呈現出與生前的人形不同的形態。如今，不少歷史上的著名人物成為“靈體”，在新的時代，述寫新的傳奇。作品獨創性的提出“魂”與“靈體”之間關系的概念——一直被人們記住的歷史人物的“魂”最后幻化成了“靈體”寄宿在了后來的一代又一代的人身上，并永不停息的持續著“他們”之間的戰爭，此所謂“魂戰紀”。

這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……