明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁(yè)，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來(lái)，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁(yè)的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。

這家叫做“妙藥堂”的中醫(yī)診所，他的擁有者是家里世代行醫(yī)的唐本草。這個(gè)診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發(fā)生了各種各樣的故事……

毛依蘭，人稱“毛豆”，毛豆和董忱源系一脈，師出同門(mén)，無(wú)奈兩人自幼便是一對(duì)小冤家，逢則必斗。陰差陽(yáng)錯(cuò)間，毛豆成了董忱后廚一員，他手把手教她做菜，毛豆也漸漸陷入了他愛(ài)情的圈套，無(wú)奈董忱身邊鶯鶯燕燕絡(luò)繹不絕，因此兩人始終也不過(guò)是鐵哥們兒。在毛豆重蹈初戀的覆轍、擺脫相親對(duì)象的追求，并經(jīng)歷了富二代的愛(ài)情之后，最終得到董忱的一顆真心。并且毛豆也在董忱的悉心教導(dǎo)和幫助下，逐漸成長(zhǎng)為名副其實(shí)的“料理女王”。

死后五百年，還被人們銘記的人，他們的靈魂便可以成為“靈體”。 根據(jù)現(xiàn)代人的印象，呈現(xiàn)出與生前的人形不同的形態(tài)。如今，不少歷史上的著名人物成為“靈體”，在新的時(shí)代，述寫(xiě)新的傳奇。作品獨(dú)創(chuàng)性的提出“魂”與“靈體”之間關(guān)系的概念——一直被人們記住的歷史人物的“魂”最后幻化成了“靈體”寄宿在了后來(lái)的一代又一代的人身上，并永不停息的持續(xù)著“他們”之間的戰(zhàn)爭(zhēng)，此所謂“魂戰(zhàn)紀(jì)”。