少年生活在一個人類與怪物共存的大陸—紙風車之國，平靜的日常下危機四伏…

在與現實世界極為相似的平行世界里，虛擬現實技術極度發達，一群在現實中身份各異的少年，進入了名為尋找公主的虛擬現實游戲中，并在游戲中成為了朋友。殊不知這是一款由掌權者打造的，一款專門用于選拔的游戲。孩子們在游戲種產生的數據會被電腦計算，篩選，最終選出智力，力量等各方面異于常人的潛力孩子，被選出的孩子將在特攻學院中進行特殊培訓，最終之戰將在現實展開。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。