明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

考古系學生依娜在望謨縣“三月三”節日中，意外被一枚琥珀吊墜帶回古夜郎世界。為返回現代，她與神鳥太芒、游俠超能栗結伴，穿越三大布依族文化秘境：以五色花米飯治愈生靈、用糠包化解姻緣之劫、借牛角抵御蟲災。途中邂逅異世少年阿布，揭開腐蝕蟲滅世危機。當月光再臨，二人重返現代，吊墜碎裂處，千年文化血脈悄然重連……