原本中醫(yī)系畢業(yè)的張機(jī)，因?yàn)橹嗅t(yī)不容樂(lè)觀的就業(yè)情勢(shì)，于是打算轉(zhuǎn)行“更有前途”的西醫(yī)。然而某天他回家后，發(fā)現(xiàn)家中多了位不速之客——醫(yī)仙【岐伯】。岐伯以“因?yàn)槟闶菑垯C(jī)（張仲景）”為理由，將“重振中醫(yī)”交給了張機(jī)。 為了讓張機(jī)可以勝任“重振中醫(yī)”的重任，岐伯遣藥?kù)`親自教導(dǎo)張機(jī)中藥的配伍使用，并將一本可以與藥?kù)`訂立契約的《玉函本草集》交由張機(jī)，同時(shí)讓人參【任弦】作為張機(jī)的幫助與監(jiān)督者。

男主原是現(xiàn)代世界普通大學(xué)生，某天偶遇算命人并被告知災(zāi)禍將至，若不破解恐性命之危。因此男主接過(guò)山海玄中錄且答應(yīng)完成書中各妖娘所在世界對(duì)應(yīng)的任務(wù)......回家后，男主翻開山海玄中錄第一頁(yè)出現(xiàn)攻略人物，瞬間被吸入書中，由此正式開啟第一個(gè)攻略任務(wù)。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫(yī)，中醫(yī)式微。少年醫(yī)者李子明機(jī)緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥?kù)`——冬葵仙子。她懇請(qǐng)世間唯一能和曾經(jīng)的李時(shí)珍一樣與藥?kù)`對(duì)話的李子明幫助藥?kù)`們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁(yè)，拯救草藥精靈們的世界，同時(shí)將《本草綱目》中記載的資料流傳下來(lái)，將中醫(yī)發(fā)揚(yáng)光大。李子明醫(yī)者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長(zhǎng)，收集殘頁(yè)的同時(shí)也與藥?kù)`們結(jié)下深厚羈絆。

二十四節(jié)氣不僅僅代表著日月運(yùn)行位置和天氣、動(dòng)植物生長(zhǎng)等自然現(xiàn)象，它還代表著華國(guó)數(shù)千年的文化精髓，以及華國(guó)人骨子里的底蘊(yùn)。小神醫(yī)四季一個(gè)聰明伶俐的小蘿莉，和活波可愛的熊貓咪嘟嘟，當(dāng)兩個(gè)小可愛遇見傳統(tǒng)的二十四節(jié)氣，會(huì)不會(huì)帶給我們一個(gè)不一樣的華國(guó)傳統(tǒng)文化呢？