天命玄鳥，降而生商。帝辛，玄鳥降生之子，大商之君，天下之主，背負著大商所有氣運。天下武學，一觸即通，世界所有，唾手可得。然而就在帝辛收服西岐，志得意滿甚至有些無聊之際，忽然被穿傳送到了現代世界，穿越了！ 帝辛發現了一個令自己驚愕的事實：在這個世界，自己竟然是小說中的人物！

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

混混少年秦明，文弱書生白齊，一個是設局人，一個是解局人；一個是陰差陽錯，一個是蓄謀已久。二人通過選拔，攜手進入金吾衛，雖屢遭到權貴刁難，二人憑借膽識及能力硬是殺出了一條血路。