怪獸橫行的末日，人人自危，我卻擁有一個可以捕捉怪物的系統！ 妖魅的蜘蛛女、體積堪比城市的巨獸，還有傳說中的黑白無常，都是我的寵物！!

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。

為房租和水電費發愁的大學老師王某，碰到了奉旨下凡普渡人間、化名“管音”的觀音，陰差陽錯之下幫助觀音化解心魔。王某為何能弱化心魔，成了觀音的心結，能弱化心魔的王某，卻不知何時心中悄悄滋養起心魔……面對人間界的煉獄景象，神仙是否能幫助人類，而人類的“心魔”又因何而來，王某等人的命途又將被牽引何處？

這家叫做“妙藥堂”的中醫診所，他的擁有者是家里世代行醫的唐本草。這個診所不光給人看病，還接待一些神秘奇異的妖怪……在大夫與病人之間，在人類與妖怪之間，發生了各種各樣的故事……