一克帝國英雄傳2承接一克帝國英雄傳漫畫劇情，是第一部的正統續作，一克帝國一統十四州后，來自四方的威脅仍未解除，大正皇王思北一聲令下開啟了十四州外異域地區的東伐西討、南征北戰，以及探秘發現未知區域及其他國度的奇幻旅程（根據小說一克帝國異域志內容改編而成）。

何雨是一位普通的女生。在她居住的和善市，自古以來有著十二生肖的守護，他們擁有人類的外表和各自不同的特殊能力，每年會有一位生肖在城市中幫助并守護著人們，然而人們對此并無察覺。在何雨的本命年（猴年），她和十二生肖的猴子申君在一次偶遇中不小心將惡靈的封印解開。惡靈將其他沉睡的十二生肖一并帶走，控制了他們的心智，使他們與人類為敵。申君和何雨一起協力作戰，阻止十二生肖對城市的破壞……

故事在廢土風格基礎上架構了一個極具頹廢氣息的末世界，具有魔族血統被視為異類的主角在爾虞我詐的世界里，希冀去實現自己近乎渺茫的理想——擁有一位真正的朋友。在主角的任務過程中，偶然結識到的一位伙伴正逐步打開著主角的心扉。

由于人族的貪婪，其他種族逐漸在一次次的混戰中隱匿了痕跡——混戰中水中界被納入地上界版圖，除了精靈族，現在地上界的情況是這樣的：異族在人族中只剩下了傳說和教會的宣傳口號，但是除了精靈族外的其他種族其實在地上界還各有活動，只是隱藏了真實身份。拉法爾，來自天上界的精靈，由于不可告人的秘密來到人間界，遇見各色各樣的人類，并與其中三個伙伴組成團隊一起粉碎邪惡的陰謀。