很久以前，妖獸橫行，禍害人間，百姓民不聊生。就在這時，一位仙人出現，他將妖獸引領到一個世外秘境，這個秘境被后人稱之為“山海界”。 數百年過去了，某一天仙人設下的結界受到破壞，部分靈獸出逃人間，為了將靈獸尋回，現任守界者靈發仙人來到人類的世界。然而此時此刻，孟然和同學正因為誤闖后山而遇到傳說中的兇獸窮奇……

小學老師安傾時隔九年與初戀對象易言城再次相遇。當年因為一次滑雪的意外，易言城成為了間接害死自己姐姐安妮的兇手，安傾雖然只身離開這座城市，但依然沒有放下對他的感情。重遇時他已是成功的上市公司總裁，兩人間如同往日般的默契再加上自己的學生趙奇奇的有意撮合之下，他們很快又再次走到了一起。然而阻擋在安傾戀愛之路上的還有很多阻礙，未婚妻葉小姐，家人的不接受，如同巨石一般壓在她的心頭，一次又一次的擾亂她的生活。

明末，人們迷信修仙煉丹拒絕求醫，中醫式微。少年醫者李子明機緣巧合之下從一本破舊的《本草綱目》中召喚出藥靈——冬葵仙子。她懇請世間唯一能和曾經的李時珍一樣與藥靈對話的李子明幫助藥靈們收集因事故四散的《本草綱目》殘頁，拯救草藥精靈們的世界，同時將《本草綱目》中記載的資料流傳下來，將中醫發揚光大。李子明醫者仁心，不忍拒絕，從此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不斷成長，收集殘頁的同時也與藥靈們結下深厚羈絆。